فاضلاب کشتارگاه نه تنها حاوی مواد آلی آلاینده قابل تجزیه بیولوژیکی است، بلکه حاوی مقدار قابل توجهی از میکروارگانیسمهای مضر نیز میباشد که در صورت رها شدن در محیط زیست میتوانند خطرناک باشند. در صورت عدم تصفیه، میتواند آسیبهای جدی به محیط زیست و انسانها وارد کند.